Multiploid APK

Cuộc sống như chúng ta biết nó đã tiếp tục gây sốc và làm chúng ta ngạc nhiên, liên tục nhắc nhở chúng ta rằng sự thật còn xa lạ hơn cả hư cấu. Euplotid là một mô hình hình học được lượng tử hóa của tế bào nhân chuẩn, một nỗ lực đầu tiên trong việc định lượng, sử dụng hình dạng hình học không đổi của planck làm cơ sở của nó, sự phức tạp đáng kinh ngạc tạo ra một tế bào sống. Bằng cách bắt đầu từ dưới cùng, chúng ta có thể xây dựng các mảnh, khi kết hợp theo thứ bậc và kết hợp, tạo ra hành vi phức tạp nổi lên mà ngay cả một sinh vật đơn bào có thể hiển thị. Euplotid bao gồm một tập hợp các khối xây dựng 3D hình học được lượng tử hóa và liên tục phát triển các đường ống sinh học được đóng gói và chạy trong các thùng chứa Docker cho phép người dùng xây dựng và chú thích cấu trúc điều tiết cục bộ của mọi gen bắt đầu từ các lần đọc trình tự tương tác DNA, khả năng tiếp cận nhiễm sắc và giải trình tự RNA. Đọc được định lượng bằng cách sử dụng các công cụ tính toán mới nhất và kết quả được chuẩn hóa, kiểm tra chất lượng và được lưu trữ. Vùng lân cận quy định cục bộ của mỗi gen được xây dựng bằng thuật toán phân vùng đồ thị dựa trên Louvain được tham số hóa bằng mô hình đùn chromatin và tương tác CTCF-CTCF. Các yếu tố điều tiết Cis được xác định bằng cách sử dụng các đỉnh khả năng tiếp cận chromatin, sau đó được ánh xạ tới các trang web bắt đầu phiên mã dựa trên sự bao gồm trong cùng một vùng lân cận. Mạng lưới thần kinh sâu được đào tạo để cung cấp một mô hình thống kê bắt chước liên kết yếu tố phiên mã, cho khả năng xác định tất cả các TF trong một đỉnh tiếp cận nhiễm sắc thể nhất định. Bằng cách biến đổi trong silico và áp dụng lại mạng lưới thần kinh, chúng tôi có thể đánh giá tác động của đột biến chuyển tiếp lên sự ràng buộc của bất kỳ yếu tố phiên mã nào. Đầu ra có chú thích có thể được hiển thị bằng nhiều cách 1D, 2D, 3D và 4D được phủ lên trên các nhóm kiến ​​thức hiện có, chẳng hạn như kết quả GWAS hoặc cấu trúc PDB. Khi một nhà sinh vật học đã xác định được một lợi ích đặc biệt của CRE, sự khó khăn của đột biến chuyển tiếp qua trung gian của Trình soạn thảo cơ sở có thể được quan sát một cách định lượng và gây ra trong một sinh vật mẫu