Multiploid APK

Bildiğimiz gibi hayat bizi şok etmeye ve şaşırtmaya devam etti, sürekli olarak gerçeğin kurgudan çok daha garip olduğunu hatırlatıyor. Euplotid, ökaryotik hücrenin nicelenmiş bir geometrik modelidir; ilk olarak, planck'ın sabit geometrik şeklini temel olarak kullanan, canlı bir hücreye yol açan inanılmaz karmaşıklığı ölçmeye yönelik ilk girişimdir. En alttan başlayarak, hiyerarşik ve kombinasyonel olarak birleştirildiğinde, tek hücreli bir organizmanın bile gösterebileceği ortaya çıkan karmaşık davranışı üreten parçaları inşa edebiliyoruz. Euplotid, bir dizi nicelleştirilmiş geometrik 3D yapı taşından ve Docker kaplarında kapsüllenmiş ve çalışan sürekli gelişen biyoinformatik boru hatlarından oluşur ve kullanıcının DNA etkileşimleri, kromatin erişilebilirliği, ham sekanslama okumaları, ve RNA dizilemesi. Okumalar en son hesaplama araçları kullanılarak nicelendirilir ve sonuçlar normalleştirilir, kalite kontrol edilir ve saklanır. Her genin lokal düzenleyici mahallesi, kromatin ekstrüzyon modeli ve CTCF-CTCF etkileşimleri ile parametreleştirilen Louvain tabanlı grafik bölümleme algoritması kullanılarak oluşturulur. Cis-Düzenleyici Elemanlar, daha sonra aynı mahalleye dahil edilmelerine göre Transkripsiyon Başlangıç ​​Sitelerine eşlenen kromatin erişilebilirlik zirveleri kullanılarak tanımlanır. Derin Sinir Ağları, transkripsiyon faktörü bağlanmasını taklit eden istatistiksel bir model sağlamak için eğitilir ve belirli bir kromatin erişilebilirlik zirvesindeki tüm TF'leri belirleme yeteneği verir. In-silico mutasyona uğratarak ve sinir ağını yeniden uygulayarak, bir geçiş mutasyonunun herhangi bir transkripsiyon faktörünün bağlanması üzerindeki etkisini ölçebiliriz. Açıklamalı çıktı, GWAS sonuçları veya PDB yapıları gibi mevcut bilgi yapılarıyla kaplanmış çeşitli 1D, 2D, 3D ve 4D yollarında görüntülenebilir. Bir biyolog tarafından belirli bir ilgili CRE tanımlandığında, Base Editor aracılı geçiş mutasyonunun zorluğu, bir model organizmada kantitatif olarak gözlemlenebilir ve uyarılabilir.