ShearFAST APK
最新版本
1.0 for Windows
更新
2020年August27日
信息
版 1.0 (#1)
更新 2020年August27日
APK档案大小 4.4 MB
Android 系统版本要求 Android 2.1+ (Eclair)
开发者 EcoCyto
类别 效率 (应用)
应用 ID appinventor.ai_Ecocyto.ShearFAST_20200518
开发者备注 用于流体剪切应力的免费,高通量模拟的体外工具集。
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新功能
ShearFAST 1.0的新功能
Initial public release
内容描述
访问我们的网站:https://ecocyto.wixsite.com/shearfast
---
关于ShearFAST:
流体剪切应力(FSS)是关键的环境刺激,已知其在健康和疾病中调节细胞生物学。
细胞摇杆,在医学研究实验室中无处不在,可以通过其跷跷板运动向培养的细胞提供恒定的流体通量(1),并已被用于识别多种细胞类型中的剪切应力的各种影响(2-6)。
但是,除了复杂的数学运算之外,定义产生的切应力水平还需要对设置在单元摇臂规格上的摇动轮廓进行高分辨率表征,而使用摇臂本身是无法真正实现的。
幸运的是,可以克服这些障碍的技术已经掌握在全世界的研究人员手中。智能手机能够检测方向变化并执行复杂的数学运算。将智能手机与手机摇杆配对是一个直观的步骤,可以促进生物医学研究中流体剪切应力的更大实验。
介绍ShearFAST
ShearFAST(公式,角度,速度工具集)(7)是一种新颖的智能手机应用程序,可检测实验室细胞摇杆上设置的摇摆角度和频率。 ShearFAST使用这些测量值和完善的数学模型(1)来计算培养细胞在跷板上所经历的特征切应力。
通过两种独立的方法验证了ShearFAST对摇摆剖面的评估(7),公式工具成功地从定义了所用数学模型的文章中复制了示例数据(1)。
免费提供ShearFAST,这是一种新颖的方法,可简化,更准确,更可再现的流体剪切应力实验
参考文献
1.周X,刘D,尤L,王L.定量摇摆培养皿中的流体剪切应力。 J Biomech [互联网]。 2010年5月28日[引自2016年4月26日]; 43(8):1598–602。可从以下网站获得:http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=2866761&tool=pmcentrez&rendertype=abstract
2. Wang W,Sarazin BA,Kornilowicz G,Lynch ME。机械加载的乳腺癌细胞通过分泌增加骨细胞树突形成和下游吸收的因子来改变骨细胞的机械敏感性。前内分泌(洛桑)[互联网]。 2018 [引自2019年5月5日]; 9:352。可从以下网站获得:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30034365
3. Cha B,Geng X,Mahamud MR,Fu J,Mukherjee A,Kim Y等。机械转导激活经典的Wnt /β-catenin信号传导,以促进淋巴管的血管形成以及淋巴和淋巴瓣膜的形成。 Genes Dev [Internet]。 2016年6月15日[引自2017年7月20日]; 30(12):1454–69。可从以下网站获得:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27313318
4. Gater R,Ipek T,Sadiq S,Nguyen D,Jones L,El Haj A等。使用3D青光眼Tenon胶囊+结膜模型研究结膜纤维化反应。眼科研究视科学[Internet]。 2019年2月6日[引自2020年5月16日]; 60(2):605。可从以下网站获得:http://iovs.arvojournals.org/article.aspx?doi=10.1167/iovs.18-25335
5. Mohammed SG,Arjona FJ,Latta F,Bindels RJM,Roepman R,Hoenderop JGJ。流体剪切应力增加了纤毛远端回旋和连接的小管细胞中Ca 2+的跨上皮运输。 FASEB J [互联网]。 2017年5月18日[引自2020年5月16日]; 31(5):1796–806。可从以下网站获得:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1096/fj.201600687RRR
6. Hyler AR,北卡罗来纳州布杜因,布朗MS,Stremler MA,Cimini D,Davalos R V等。流体剪切应力影响卵巢癌细胞的生存能力,亚细胞组织,并促进基因组不稳定。 PLoS One [Internet]。 2018 [引自2019年5月5日]; 13(3):e0194170。可从以下网站获得:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29566010
7. Smith TB,Nunzio AM De,Patel K,Munford H,Alam T,Powell O等。 ShearFAST:一种用户友好的体外工具集,用于高通量,廉价的流体剪切应力实验。 bioRxiv。 2020年2月2日; 2020.01.31.929513。
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关于ShearFAST:
流体剪切应力(FSS)是关键的环境刺激,已知其在健康和疾病中调节细胞生物学。
细胞摇杆,在医学研究实验室中无处不在,可以通过其跷跷板运动向培养的细胞提供恒定的流体通量(1),并已被用于识别多种细胞类型中的剪切应力的各种影响(2-6)。
但是,除了复杂的数学运算之外,定义产生的切应力水平还需要对设置在单元摇臂规格上的摇动轮廓进行高分辨率表征,而使用摇臂本身是无法真正实现的。
幸运的是,可以克服这些障碍的技术已经掌握在全世界的研究人员手中。智能手机能够检测方向变化并执行复杂的数学运算。将智能手机与手机摇杆配对是一个直观的步骤,可以促进生物医学研究中流体剪切应力的更大实验。
介绍ShearFAST
ShearFAST(公式,角度,速度工具集)(7)是一种新颖的智能手机应用程序,可检测实验室细胞摇杆上设置的摇摆角度和频率。 ShearFAST使用这些测量值和完善的数学模型(1)来计算培养细胞在跷板上所经历的特征切应力。
通过两种独立的方法验证了ShearFAST对摇摆剖面的评估(7),公式工具成功地从定义了所用数学模型的文章中复制了示例数据(1)。
免费提供ShearFAST,这是一种新颖的方法,可简化,更准确,更可再现的流体剪切应力实验
参考文献
1.周X,刘D,尤L,王L.定量摇摆培养皿中的流体剪切应力。 J Biomech [互联网]。 2010年5月28日[引自2016年4月26日]; 43(8):1598–602。可从以下网站获得:http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=2866761&tool=pmcentrez&rendertype=abstract
2. Wang W,Sarazin BA,Kornilowicz G,Lynch ME。机械加载的乳腺癌细胞通过分泌增加骨细胞树突形成和下游吸收的因子来改变骨细胞的机械敏感性。前内分泌(洛桑)[互联网]。 2018 [引自2019年5月5日]; 9:352。可从以下网站获得:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30034365
3. Cha B,Geng X,Mahamud MR,Fu J,Mukherjee A,Kim Y等。机械转导激活经典的Wnt /β-catenin信号传导,以促进淋巴管的血管形成以及淋巴和淋巴瓣膜的形成。 Genes Dev [Internet]。 2016年6月15日[引自2017年7月20日]; 30(12):1454–69。可从以下网站获得:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27313318
4. Gater R,Ipek T,Sadiq S,Nguyen D,Jones L,El Haj A等。使用3D青光眼Tenon胶囊+结膜模型研究结膜纤维化反应。眼科研究视科学[Internet]。 2019年2月6日[引自2020年5月16日]; 60(2):605。可从以下网站获得:http://iovs.arvojournals.org/article.aspx?doi=10.1167/iovs.18-25335
5. Mohammed SG,Arjona FJ,Latta F,Bindels RJM,Roepman R,Hoenderop JGJ。流体剪切应力增加了纤毛远端回旋和连接的小管细胞中Ca 2+的跨上皮运输。 FASEB J [互联网]。 2017年5月18日[引自2020年5月16日]; 31(5):1796–806。可从以下网站获得:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1096/fj.201600687RRR
6. Hyler AR,北卡罗来纳州布杜因,布朗MS,Stremler MA,Cimini D,Davalos R V等。流体剪切应力影响卵巢癌细胞的生存能力,亚细胞组织,并促进基因组不稳定。 PLoS One [Internet]。 2018 [引自2019年5月5日]; 13(3):e0194170。可从以下网站获得:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29566010
7. Smith TB,Nunzio AM De,Patel K,Munford H,Alam T,Powell O等。 ShearFAST:一种用户友好的体外工具集,用于高通量,廉价的流体剪切应力实验。 bioRxiv。 2020年2月2日; 2020.01.31.929513。
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